Device operating system update
- Home
- Documentation
- Device operating system update
GridION: Protocol
Device operating system update V DOS_9133_v1_revL_25Nov2021
For Research Use Only.
FOR RESEARCH USE ONLY
Contents
Actualizar el sistema operativo en el GridION
- 1. Descargar y grabar una imagen ISO en una unidad USB
- 2. Cómo arrancar el dispositivo desde una memoria USB
- 3. Restablecer los valores de fábrica
- 4. Si surgen problemas
Actualización del sistema operativo
Descripción general
For Research Use Only.
1. Descargar y grabar una imagen ISO en una unidad USB
Descripción general
Las siguientes instrucciones le ayudarán a crear una unidad USB de arranque que sirva para reconstruir el sistema operativo en su dispositivo.
Estas instrucciones son para los usuarios que no recibieron una unidad USB con imagen ISO. Si ha recibido una unidad USB, pase al siguiente punto: Cómo arrancar el dispositivo desde una memoria USB.
IMPORTANTE
Recomendamos transferir los datos a una copia de seguridad, incluso si se escoge una opción que conserve los datos. Esto se debe a que los archivos ISO pueden corromperse a mitad del proceso (por ejemplo, debido a una desconexión del USB, un corte de electricidad, etc.).
Descargar el archivo ISO en el siguiente enlace:
Grabar el archivo ISO en una unidad USB
El programa adecuado para grabar la imagen ISO es: Rufus en Windows
Nota: la herramienta de grabación ISO alternativa balenaEtcher no es compatible con nuestra imagen ISO. Necesitará acceso a un ordenador Windows y tal vez derechos de administrador para instalar el programa Rufus.
Al grabar el archivo ISO, utilizar los siguientes ajustes (se debe usar un arranque EFI/GPT):
- Esquema de partición: GPT
- Sistema de destino: UEFI
La unidad USB debe tener las siguientes características:
- Tener 32 GB o más
- USB 3.0 recomendado
- Utilizar la opción de arranque UEFI
Nota: Recomendamos grabar una imagen de disco en dos unidades USB de un proveedor distinto, como copia de seguridad. Las unidades USB habituales pueden fallar en la reinstalación de los dispositivos sin un motivo aparente.
2. Cómo arrancar el dispositivo desde una memoria USB
Apagar el GridION.
Insertar el USB de arranque en el puerto USB con interior azul, situado en la parte posterior del dispositivo.
Si el dispositivo tiene números de serie GXB01xxx o GXB02xxx, siga las instrucciones del paso 3, apartado a. Si el dispositivo tiene un número de serie GXB03xxx, siga las instrucciones del paso 3, apartado b.
Encender el GridION.
a. Cuando aparezca la pantalla ASRock, presionar F11 para entrar en el menú de inicio. Seleccionar la opción de arranque USB UEFI. Pulsar Enter Setup.
b. Cuando aparezca la pantalla ASUS, presionar Del para entrar en el menú de arranque. Con ayuda del ratón, en Boot Override pulsar UEFI: [Nombre del USB] [Información del USB]. De este modo, aparecerá el siguiente menú.
En la siguiente pantalla, procure que la opción "Customer Factory Reset image" esté resaltada. Esta opción detectará su instalación e intentará mantener las configuraciones de red, el nombre del servidor y la partición /data. Pulsar Aceptar. Siempre que sea posible, recomendamos hacer copias de seguridad de los datos antes de continuar con este paso.
Opción | Para qué sirve | Cuándo usar esta opción |
---|---|---|
Restablecimiento de los valores de fábrica | - Mantiene la configuración de red - Mantiene el nombre del servidor (por ejemplo, PCA1XXX) - Conserva los datos - No borra los metadatos ni formatea los discos | - Para restablecer el dispositivo a una versión de MinKNOW reflejada en el nombre de la imagen (por ejemplo, 22.10 ISO = MinKNOW 22.10) - Para restablecer el dispositivo a un estado conocido mientras intenta conservar los datos existentes |
Restaurar, instalar y mantener /data | - Mantiene la configuración de red - Mantiene el nombre del servidor (por ejemplo, PCA1XXX) - Conserva los datos - No borra los metadatos ni formatea los discos | Desde el punto de vista funcional, idéntico a la opción Customer Factory Reset/Restablecimiento de los valores de fábrica |
Formatear discos y perder /data | - No mantiene la configuración de red - No mantiene el nombre del servidor - No guarda los datos - Borra los metadatos y da formato a los discos | - Problemas con el almacenamiento de datos o una nueva unidad de disco sin formato (por ejemplo, una unidad defectuosa o reemplazada) - Si la opción Mantener /data no resuelve el problema |
BORRADO SEGURO - puede tardar horas | - No mantiene la configuración de red - No mantiene el nombre del servidor - No guarda los datos | Usar solo si lo solicita un miembro del Servicio Técnico: Esta opción borra completamente los discos y pone todos los datos a 0 |
Entonces aparecerá la pantalla de abajo. Seleccionar “Instalación estándar”. Entonces aparecerá un mensaje de confirmación; seleccionar “Okay”.
Nota: la ventana de instalación azul tal vez ocupe toda la pantalla. Pulsar Esc para ver el menú en el navegador predeterminado.
En este punto aparecerá la siguiente pantalla. La evolución se mostrará en la barra de estado. El proceso tardará en finalizar 1 h aproximadamente.
Nota: Es normal que el sistema se reinicie varias veces.
Es posible que la pantalla de abajo se vea más de una vez después de que el dispositivo se reinicie varias veces; el GridION tal vez parezca atascado, pero debería continuar tras un máximo de 30 minutos. No es necesario hacer nada mientras se actualiza el sistema, incluso si aparece esta pantalla.
Una vez finalizada la actualización, se mostrará la pantalla estándar de inicio de sesión. Tras iniciar sesión, aparecerá el icono de MinKNOW en el escritorio. Si no aparece, realice un último ciclo de encendido.
Los cambios realizados en la contraseña del dispositivo se restablecerán a la contraseña predeterminada “grid”. Si tiene que actualizar la contraseña predeterminada, aquí encontrará las instrucciones.
Abrir MinKNOW y comprobar que detecta todas las posiciones de celdas de flujo. Si no es así, apagar y encender el dispositivo de nuevo.
3. Restablecer los valores de fábrica
Ir al Explorador de archivos, seleccionar el icono de expulsión junto al dispositivo USB y expulsar la USB de arranque.
La primera vez que se encienda, el dispositivo puede tardar varios minutos en reconocer el teclado y el ratón.
Pulsar Ctrl+Alt+T, lo que abrirá el terminal
Si el nombre del servidor no se ha mantenido durante la restauración del sistema (debe ser visible en la línea de comandos), escribir:
ont-gridion-serial set GXBXXXX
donde GXBXXXX
es el identificador de serie, tal como se incluye en la etiqueta de la parte posterior del dispositivo.
Pulsar Aceptar.
Escribir "bash"; a continuación, pulsar Aceptar.
Configurar la red.
Hemos redactado un script para ayudarle a configurar la red. Abrir una ventana del terminal e introducir:
ont-network-settings
Las opciones de este script son:
--dhcp
(opcional) - Utilizar DCHP elimina la necesidad de todas las demás características excepto la interfaz, el enlace y la sobrescritura --address ip_address
(obligatorio) - Dirección IP del dispositivo --subnet subnet_mask
(obligatorio) - Máscara de subred --gateway gateway_address
(obligatorio) - puerta de enlace predeterminada --dns DNS_server1,DNS_server2
(obligatorio) - Servidores DNS --search your_domain
(obligatorio) - el sufijo de su dominio (por ejemplo, tuempresa.local) --overwrite
(opcional) --help
- Datos de las opciones anteriores
Para actualizar la configuración, ejecutar el comando adecuado de entre las opciones anteriores con la bandera --overwrite
y reiniciar el dispositivo.
Abrir MinKNOW y comprobar si hay actualizaciones disponibles o buscar actualizaciones en el terminal:
sudo apt update
sudo apt install ont-gridion-release
ont-system-test
(no disponible con algunas imágenes ISO)
ont-validate-install
Si la instalación se ha realizado correctamente, debería ver el siguiente mensaje:
Se han instalado todo los paquetes y nvidia funciona correctamente; ont-restore-apt se está restableciendo
Si se han producido problemas en la instalación, ejecutar los siguientes comandos:
sudo apt update
sudo apt dist-upgrade
sudo ont-validate-install
sudo reboot
Si el problema no se resuelve, contacte con el servicio de asistencia técnica en support@nanoporetech.com.
4. Si surgen problemas
Si el proceso de instalación no restablece su equipo correctamente, vuelva a "Cómo arrancar desde USB", continúe desde el paso 4 y siga las instrucciones que se detallan a continuación.
Tras elegir la opción UEFI, pulsar Aceptar; seleccionar la opcion Format disks and lose /data. Esta opción restablecerá los discos y reconstruirá el sistema. Cuando la instalación haya finalizado, deberá introducir manualmente el nombre del servidor.
El proceso de reconstrucción primero dejará en blanco todos los discos del sistema y luego se reiniciará. Continuar con la instalación como se describe en el paso 4 y seleccionar “Customer factory reset”.
Si no aparece la pantalla del paso 5 —"Cómo arrancar desde USB"— y en su lugar se ve una pantalla negra con texto en blanco, reiniciar el GridION (mantener presionado el botón de encendido durante unos segundos) y luego proceder con el paso 3.
Durante el proceso de borrado de los discos del sistema, se verá la siguiente pantalla que mostrará un texto de ASRock o ASUS con un círculo de desplazamiento. Es posible que el proceso tarde en finalizar y que sea necesario reiniciar el equipo.
Si elige una de las opciones de restablecimiento habituales (cualquiera excepto la del Borrado seguro) y el GridION se bloquea o se produce un error durante el proceso, realice un "Borrado seguro".
Si se elige la última opción, "Borrado seguro" se perderán los datos y borrarán los discos duros. Si después del "Borrado seguro" y el restablecimiento de los valores de fábrica, el GridION no se enciende, póngase en contacto con el servicio de asistencia técnica (support@nanoporetech.com), ya que esto indicaría un posible error en el equipo.