PromethION 24/48 A-系列 - 设备及 IT 配置规格
Requirements
PromethION 24/48 A-系列 - 设备及 IT 配置规格
FOR RESEARCH USE ONLY
Contents
设备型号
设备与 IT 配置规格
常见问题
附录 A:运输和物流
附件B:兼容性
变更记录
设备型号
PromethION A-系列数据采集单元(PRO-PRCAMP;PRO-PRCA100)
PromethION 24 测序单元 (PRO-SEQ024)
PromethION 48 测序单元 (PRO-SEQ048)
PromethION 24 Combined (PRO-CMB024)*
*仅限部分国家销售
设备与 IT 配置规格
概览

PromethION™ 24/48 A 系列是一款高通量纳米孔测序平台,可并行运行多达24或48张测序芯片。对于希望充分发挥纳米孔测序优势、并行推进多个项目的实验室而言,PromethION 是理想之选。
- 精简的文库制备
- 实时分析
- 长读长带来的深度解析
得益于强大的内置计算功能,PromethION 可独立进行设备控制、数据采集、碱基识别、和数据流传输,且无需任何附属IT基础设施。
点击此处,获取有关 PromethION 24 的更多信息。
技术规格
| 组成 | 规格 |
|---|---|
| 操作系统 | Ubuntu Focal (20.04) / Ubuntu Noble (24.04) |
| 存储 | 60 TB 内置固态硬盘(可用容量 56 TB) |
| GPU | 数据采集单元: 4 × NVIDIA Ampere 系列 GPU + 1 × Turing 系列 GPU(专用于图形显示) |
| 内存 | 512 GB 内存 |
| 尺寸和重量 | 测序单元:190(高) x 590(长) x 430(宽) mm; PromethION 24:23 Kg PromethION 48:31 Kg 数据采集单元:H 440 × W 178 × D 470 mm; 26 kg |
| 最优测序温度范围 | 请在+18℃至+22℃的环境温度范围内使用本测序设备* |
| 最大热量输出 | 测序单元:4129 BTU/小时 数据采集单元:9008 BTU/小时 |
| 电源 | 测序单元:100–240 VAC (50/60 Hz); 最大功率:1210 W 插头类型:1 × C13 电源接口 数据采集单元:200–240 VAC (50/60 Hz); 最大功率:2640 W 插头类型:2 × C13 电源接口 |
*电子原件的工作环境温度为+5℃至+40℃。
安装场地规划(交付前)
安装检查清单
本清单列出了在贵机构安装 PromethION™ 24/48 A 系列所需的最低 IT 与基础设施配置。有关每项要求的详细说明,请参阅后续章节。
请注意:
- 系统支持光纤或铜缆网络连接。
- PromethION 24 Combined 仅限部分国家销售,其 IT 配置要求与 PromethION 24 A系列一致。
| 所需项目/设置 | 用途 |
|---|---|
| 两个支持10 GBASE-SR 或 10GBASE-LR的SFP+光模块(如使用铜缆,则无需考虑此项要求) | 连接到 IT 基础架构和互联网 |
| 与所选 SFP +模块相匹配的10 Gbps电缆,或支持10 Gbps宽带的电缆 | 连接到 IT 基础架构和互联网 |
| 2 × 10 Gbps 光纤端口(需启用 DHCP), 或 2 x 10 Gbps 以太网端口(支持 DHCP 或静态 IP) | 连接到 IT 基础架构和互联网 |
| 有线 USB 鼠标与键盘 | 仪器控制 |
| 支持 DisplayPort(推荐)或 VGA 的显示器 建议分辨率:1920x1080 | 仪器控制 |
| 2 X 200–240 VAC (50/60 Hz) 电源插座 1 X 100–240 VAC (50/60 Hz) 电源插座 详情请见下文 | 仪器供电 |
| 不间断电源 UPS(非必需,详见第 7.1 节) | 电源稳定性保障 |
| 充足的本地存储与网络资源 | 实时数据传输及长期数据存储 |
电源与 UPS 配置要求
电源需求
PromethION 24/48 由两个主要部件组成:测序单元(最大功耗 1210 W)和数据采集单元(最大功耗 2640 W),二者电源需求独立。安装前,请确认本地电力系统能够满足上述功率与电压要求,并确保安装现场具备适合的电源插座。我们建议您与设施管理团队及/或专业电工确认,确保供电方案合理可行。
电源稳定性
稳定的供电是保障测序顺利进行和系统可靠运行的核心要素。我们强烈建议您为测序单元和数据采集单元配置不间断电源(UPS)。
不间断电源(UPS)的作用
不间断电源(UPS)可提供备用电力并稳定电压。在发生停电或电压波动时,UPS 可以:
- 在数分钟内维持系统运行;
- 触发警报,以便用户及时暂停或安全终止测序实验;
- 通过稳定或改善电力质量,避免因供电不稳引发的风险。
UPS 推荐规格
您可选用以下两种方式:
- 单台 UPS:使用一台大功率 UPS,同时支持测序单元和数据采集单元;
- 双台 UPS:使用两台独立 UPS,分别支持测序单元和数据采集单元。
最佳选择取决于现场条件,如空间、电源接入方式及预算。在 UPS 单元能够满足整体功率和备用能力要求的前提下,两种配置方式均可行。建议您咨询设施管理团队或/及专业电工,以确定最适配置方案。
| 参数 | 最低要求 |
|---|---|
| 功率等级 | 测序单元:1.5 kVA 数据采集单元:3 kVA |
| UPS 类型 | 在线/双变换 |
| 切换时间 | <5 分钟 |
| 电池续航 | ≥5 分钟(用于安全关机或发电机切换) |
| 输出类型 | 纯正弦波 |
| 输出电压 | 200–240 VAC @ 50/60 Hz |
| 电源线 | 请确保所用电源线的额定值不低于 10 A 250 VAC,且兼容 PromethION 24/48 的 C13 电源输入口。 |
用户需自行准备UPS。Oxford Nanopore Technologies™ 不提供或验证 UPS。用户需自行负责 UPS 的选型、安装与维护。
安装注意事项
- 如条件允许,建议您在测序设备交付前完成 UPS 安装,以避免延误;
- 应定期维护 UPS,以确保持续的供电保护;
- 为相关人员提供安全关机操作培训,以确保在断电情况下将风险降至最低。
网络与连接要求
网络访问要求
系统仅需通过 TCP 80 和 443 端口进行出站连接,无需入站访问。
Oxford Nanopore 无法远程访问您的系统。
需访问域名
为保证系统功能正常运行,需开放以下域名的出站访问权限:
| 访问类型 | 用途 | 需访问域名 |
|---|---|---|
| 遥测 | 支持 MinKNOW 执行遥测功能并传输遥测数据 | ping.oxfordnanoportal.com |
| 软件与操作系统更新 | 获取 MinKNOW 更新、操作系统软件包和 GPU 驱动程序 | cdn.oxfordnanoportal.com*.ubuntu.com*.nvidia.com |
| EPI2ME™ | 提供容器化的分析流程 | *.github.comhub.docker.com |
| Nanopore 账户登录 | 登录 Oxford Nanopore 账户并访问相关云端服务 | id.nanoporetech.com*.okta.com |
| 远程访问 | 通过同一局域网内的计算机远程访问 Nanopore 设备 | 若局域网在设备与远程计算机之间设有防火墙,请在本地网络中启用以下端口(注:所列端口基于 TCP 协议,仅用于内部网络,无需对外网开放)。 MinKNOW 独立版 GUI:端口 8000-9000、9501、 9502、 9504、9505、9800 ssh:端口 22 Samba/文件共享:端口 137-139、445 API:端口 443 |
如您的机构使用代理服务器或防火墙,请确保已开放上述域名的出站访问,以保证软件更新、功能运行及用户身份验证的正常进行。
遥测
MinKNOW 和 EPI2ME 在测序运行期间将依据相关条款收集遥测数据,用于设备性能监控、故障排查与技术支持,并作为芯片质保更换的依据(如适用)。用于设备性能监控、故障排查与技术支持,并作为芯片质保更换的依据(如适用)。
隐私提示:由于部分遥测字段支持自由文本输入,请避免填写任何可识别个人身份的信息。我们不会收集测序数据。
包装盒内容物
PromethION 24/48 测序单元
| 数量(P24/P48) | 部件 | 功能 |
|---|---|---|
| 1 | PromethION 24/48 测序单元 | DNA/RNA 测序仪器 |
| 2/3 | USB-A 转 USB Mini-B 线缆 | 用于测序单元固件更新 |
| 1 | USB-B 转 USB-A 线缆 | 用于测序单元固件更新 |
| 24/48 | 配置测试芯片 | 用于验证测序硬件功能(每个测序位置一张) |
| 1 | 快速入门指南 | 系统设置概览 |
| 1 | 安全性及合规性文件 | 安全信息与合规细则 |
| 1 1 1 1 1 | 英国(Type G → C13) 两米 10 A 250 VAC 电源线 欧盟(Schuko Type C → C13)两米 10 A 250 VAC 电源线 美国(Type B → C13)两米 5 A 125 VAC 电源线 中国(Type I → C13)两米 10 A 250 VAC 电源线 澳大利亚(Type I → C13)两米 10 A 250 VAC 电源线 | 测序单元电源线(按地区适配) |
数据采集单元
| 数量(P24/P48) | 部件 | 功能 |
|---|---|---|
| 1 | 数据采集单元 | 提供仪器控制、数据采集、碱基识别,及数据流传输 |
| 2 / 3 | 两米 PCIe 线缆 | 建立数据采集单元与测序单元之间的高速数据连接 |
| 1 | 两米 Mini DisplayPort 转 DisplayPort 线缆 | 连接数据采集单元与显示器 |
| 1 | USB-A 转 USB-C 转换器 | 将外设连接到数据采集单元的 USB-C 接口 |
| 1 | 64 GB 出厂恢复 U 盘 | 系统恢复与恢复出厂设置 |
| 2 2 2 2 2 | 英国(Type G → C13) 两米 10 A 250 VAC 电源线 欧盟(Schuko Type C → C13)两米 10 A 250 VAC 电源线 美国(NEMA L6-20P → C13)两米 15 A 250 VAC 电源线 中国(Type I → C13)两米 10 A 250 VAC 电源线 澳大利亚(Type I → C13)两米 10 A 250 VAC 电源线 | 数据采集单元电源线(按地区适配) |
设备安装
- PromethION 安装所需台面空间为 167 cm × 75 cm;
- 测序单元和数据采集单元仪器应放置于稳固的工作台上;
- 在设备的前、后及两侧预留至少 30 厘米空间,以确保充分通风并便于操作;
- 将设备置于可控环境中:避免阳光直射和热源,防止温度调节异常;保持无尘,并远离敞开窗户,以降低污染风险和气流干扰。
- 数据采集单元可根据需要放置在实验台下方。若计划以此方式安装 PromethION Combined,请预先咨询 Oxford Nanopore。
数据格式与分析
文件类型
Nanopore 测序数据通常以以下几种文件类型存储:
FASTQ - 一种基于文本的序列储存格式,用于保存 DNA 或 RNA 序列及其对应的质量评分(Q 值);
BAM - 用于存储经过比对的序列数据,包含修饰碱基信息(如甲基化等);
sequencing_summary.txt- 储存了单次测序中,与测序序列及碱基识别相关的元数据。其中包括:序列片段编号、序列长度、每条序列片段的质量值、测序时长等。该序列摘要文件的大小取决于所包含的序列片段数量。
可选格式:
- POD5 - 原始数据的标准存储格式,是对早期 FAST5 格式的替代,具有更高的数据存储与处理效率。
下表列出了单张测序芯片在不同测序通量下预计生成的文件大小,涵盖 POD5、FASTQ 和 BAM 三种数据格式,序列片段的 N50 长度为 23 kb。
| 测序芯片产出(Gbases) | FASTQ.gz (Gbytes) | 未经比对的BAM(带修饰) (Gbytes) | (可选格式) POD5 (Gbytes) |
|---|---|---|---|
| 100 | 65 | 60 | 700 |
| 200 | 130 | 120 | 1400 |
请注意:若启用碱基识别功能,系统将生成 FASTQ 和/或 BAM 文件,并在测序运行期间需要额外的临时存储空间。如果选择启用 POD5 输出,系统将在实验过程中持续生成 POD5 文件。
EPI2ME 分析
EPI2ME 桌面应用程序支持用户灵活配置本地或云端数据分析流程:
本地分析:在本地计算机上运行,利用本地计算资源执行分析任务;
云端分析:依托 Amazon Web Services(AWS)平台,需保持互联网连接。
点击此处,了解 EPI2ME 如何助力您的数据分析工作。
数据上传格式:EPI2ME 支持上传 FASTQ、BAM 及其他与分析流程相关的文件格式。所上传数据将通过定制的 Nextflow 流程进行处理,并生成交互式 HTML 报告。
软件更新
您可通过 MinKNOW 界面或终端(使用 apt)下载更新。系统仅需具备出站访问权限。 我们会在 Nanopore 社区发布软件更新通知,并在发布公告中提供完整的更新操作说明。
数据处理与存储
实时数据传输
测序过程中,设备的内置存储仅作为临时缓存,在满负荷运行时会迅速耗尽。为避免因存储不足导致测序运行中断,请务必将数据实时传输至外部存储。
PromethION 24/48 A 系列配备两个 10 Gbps 网络端口(支持光纤或以太网),用于高速数据传输。请按需选择端口,并连接至基于 SSD 的网络存储系统。USB 端口带宽不足,无法支持大规模数据的实时传输,因此不应使用。
若实时传输失败或带宽不足,测序运行可能会意外中断。
预计传输时间
下表列出了在不同测序芯片配置下,使用 1 Gbps 和 10 Gbps 网络连接时的预估数据传输时长:
| 测序芯片配置 | 1 Gbps 传输时长 | 10 Gbps 传输时长 |
|---|---|---|
| 1 × 200 Gbase 测序芯片 | ~7 小时 | ~1 小时 |
| 24 × 200 Gbase测序芯片 | ~160 小时 | ~16 小时 |
请根据以上信息评估本地带宽需求,并据此合理规划基础设施。
存储建议
为确保数据处理的稳定性和长期可用性,建议采取以下存储策略:
- 短期存储:测序期间,使用基于 SSD 的网络存储(如 NFS 或 CIFS),以支持高速实时数据传输。
- 长期归档:测序完成后,您可将数据转移至写入速度较低但更具成本效益的归档型存储系统。
- 文件格式选择:
- 如计划后续重新进行碱基识别,或所用工具依赖原始信号数据,建议保留 POD5 文件;
- 若仅需开展下游分析,而无需重新处理原始数据,可仅保留 FASTQ 文件。
Oxford Nanopore Technologies 不对存储容量或架构提出统一要求,具体配置应视使用场景而定。我们建议您与本地 IT 团队协作,明确以下事项:
- 实时数据传输架构
- 短期高速存储方案
- 长期归档存储能力
安全与合规
设备型号标识
仪器型号:
PRO-PRCAMP (PromethION A 系列 数据采集单元)
PRO-SEQ024(PromethION 24 测序单元)
PRO-SEQ048 (PromethION 48 测序单元)
PRO-CMB024 (PromethION 24 Combined*)
*仅限部分国家销售
适用领域
PromethION A 系列是一款为科学研究设计的电子分析平台。 其核心技术基于纳米孔,可用于 DNA、RNA、蛋白质及其他小分子的单分子水平研究。
本产品仅供研究使用。
安全性信息
在使用前,请遵循以下安全指南:
- PromethION 24 Combined 必须由 Oxford Nanopore Technologies 的现场服务工程师开箱及安装;
- 将系统放置在稳固的工作台上,并确保具有良好的通风条件;
- 设备前后及两侧需预留至少 30 cm 的空间;
- 使用环境应清洁无尘,并远离敞开的窗户。
紧急措施
如遇紧急情况:
1.使用电源开关关闭 PromethION A 系列设备;
2.从设备后方拔出所有电源线。
符合性声明
PromethION A 系列 符合下述《EC 合格声明》中所述的电磁兼容性(EMC)和电气安全指令。
PromethION 24 及 48 测序单元符合性声明
PromethION A 系列 数据采集单元符合性声明
PromethION 24 Combined 符合性声明
合规标识
PromethION 24 合规标识
PromethION 48 合规标识
PromethION 48 测序单元
许可及保修
许可协议及保修合同中对向用户提供最新的硬件和软件作出了说明,以确保您的仪器一直处于最佳性能。Oxford Nanopore Technologies 会在合同期内,履行Nanopore产品的条款和条件第4和第7节中所规定的支持义务。
更多信息,请参阅 Oxford Nanopore 商城中的 支持计划页面 。
常见问题
测序运行过程中,如何将数据从 PromethION 导出?
软件内置了支持实时数据传输的脚本。如需帮助,请联系 support@nanoporetech.com。
哪些 SFP+ 光模块与 PromethION 兼容?
任何 SPF+ 光模块均可兼容,请选择适合贵机构基础设施的 SFP+ 模块。
我可以使用哪些存储选项?
PromethION 可连接至任何 NAS(网络附加存储)系统。建议您结合上述指南,与本地 IT 团队协商,确定最适存储方案。
附录 A:运输和物流
Oxford Nanopore Technologies 会为 PromethION 设备提供防护包装,并根据不同型号采用单箱或双箱运输。每个包装箱配有托盘底座,便于搬运,并内置数据记录装置,用于监测运输过程中的加速度、方向、温度和湿度。
如果您发现包装箱有破损或其他明显的异常迹象,请拒收并立即联系 Oxford Nanopore 客户服务(support@nanoporetech.com)。
运输配置
- PromethION 24/48 A 系列 多数国家以双箱形式运输,数据采集单元与测序单元分别独立包装。
- PromethION 24 Combined 该型号仅在特定国家供应,为单箱运输。
重要信息:PromethION 24 Combined 必须由 Oxford Nanopore Technologies 的现场服务工程师开箱并完成安装。
所有系统均在常温(+15 ℃ 至 +25 ℃)条件下储存运输。
运输箱规格
| 组成 | 重量(kg) | 大小(高 x 宽 x 深,cm) |
|---|---|---|
| PromethION A 系列数据采集单元 | 37 | 45 × 68 × 60 |
| PromethION 24 测序单元 | 33 | 59 × 70 × 54 |
| PromethION 48 测序单元 | 44 | 59 × 70 × 54 |
| PromethION 24 Combined | 120 | 90 × 120 × 100 |
附件B:兼容性
PromethION 24/48 A 系列兼容所有最新版本的 PromethION 测序芯片、测序试剂盒及相关扩展包。
兼容范围包括:
测序芯片:PromethION R10 系列测序芯片(FLO-PRO114M)、 RNA004 PromethION 测序芯片(FLO-PRO004RA)
测序试剂盒:PromethION 24/48 兼容所有 V14 试剂盒,包括连接法、快速、条形码、PCR、cDNA 及直接 RNA 试剂盒。 下述试剂盒未经测试:
- 16S 条码测序试剂盒 1-24(SQK-16S114.24)
测序软件(最新版本):MinKNOW, Dorado 碱基识别服务器
下游分析软件:EPI2ME(含预置分析流程), Oxford Nanopore 提供的分析流程(MinKNOW 兼容)、 用户自行开发的分析工具 (由纳米孔社区开发)
变更记录
| 日期 | 版本 | 更新内容 |
|---|---|---|
| 2026年1月7日 | 1 | 本文件整合了 PromethION 24/48 技术规格 和 IT 配置要求,形成统一文档。 原有文档现已归档。 新增内容: - 合并两份文档,并重新组织文档结构; - 优化了兼容性章节的表述:以简要说明替代试剂盒代码清单,列出兼容的试剂盒和软件,并标明例外情况; - 新增 UPS 选择与适用性说明; - 新增关于包装盒所含物品的详细说明。 |