Oxford Nanopore 用户会 | 广州场
Oxford Nanopore诚邀您参与我们在广州生物岛举办的用户会。
本次活动将围绕动植物基因组、临床研究、转录组以及病原微生物等多个应用方向，分享来自本地科研与临床领域的前沿研究分享与实践案例。 会议将结合近年来具有代表性的项目成果，邀请行业专家与用户共同探讨纳米孔测序技术在不同场景下的创新应用与发展趋势。同时，活动还将包含 Oxford Nanopore 团队带来的最新技术更新。
活动信息持续更新中，敬请期待！
报告摘要及嘉宾信息
张 兴坦, 研究员/博导, 中国农业科学院深圳农业基因组研究所中国农科院深圳农业基因组所研究员、博导，热带作物生物育种全国重点实验室副主任，国家基金委优秀青年基金获得者。从事植物基因组学研究，开发一系列算法工具完成高重复的性染色体、高杂合的二倍体基因组和首个同源多倍体（甘蔗）基因组分型组装。研究成果发表于Cell、Nature、Nature Genetics、Nature Plants 等学术期刊。
真核生物的pre-mRNA能够通过选择性加工形成不同的RNA异构体，RNA修饰是否能够选择性地标记这些RNA异构体并不清楚。通过ONT直接RNA测序（DRS）结合内源性标记以及半监督学习的方法，我们建立了在单分子水平通过电流信号检测多种RNA修饰的深度学习算法,为解析RNA修饰在异构体上的分布模式奠定了基础。
真核生物的pre-mRNA能够通过选择性加工形成不同的RNA异构体，RNA修饰是否能够选择性地标记这些RNA异构体并不清楚。通过ONT直接RNA测序（DRS）结合内源性标记以及半监督学习的方法，我们建立了在单分子水平通过电流信号检测多种RNA修饰的深度学习算法,为解析RNA修饰在异构体上的分布模式奠定了基础。
王 金凯, 教授/博导, 中山大学中山医学院Oxford Nanopore直接RNA测序技术（ONT dRNA-seq）可对全长天然RNA分子进行直接测序，同步获取碱基序列、poly(A)尾长度及多种表观修饰等多模态信息，已成为RNA生物学研究的前沿工具。然而，现有方法在文库构建中对RNA起始量要求较高，且缺少有效的样品混样方案；在生信分析中，全长转录本的识别与定量软件准确性仍有不足。针对上述问题，我们通过一系列方法优化，在极微量样本建库测序以及降低数据分析假阳性方面取得了进展，为更精准的全长转录本多模态解析提供了新策略。
Oxford Nanopore直接RNA测序技术（ONT dRNA-seq）可对全长天然RNA分子进行直接测序，同步获取碱基序列、poly(A)尾长度及多种表观修饰等多模态信息，已成为RNA生物学研究的前沿工具。然而，现有方法在文库构建中对RNA起始量要求较高，且缺少有效的样品混样方案；在生信分析中，全长转录本的识别与定量软件准确性仍有不足。针对上述问题，我们通过一系列方法优化，在极微量样本建库测序以及降低数据分析假阳性方面取得了进展，为更精准的全长转录本多模态解析提供了新策略。
石 卓兴, 助理研究员, 中山大学 中山眼科中心
孙 光超, 特聘教授/博士生导师, 四川农业大学孙光超， 男， 博士，四川农业大学高层次引进人才（领军人才）特聘教授，博士生导师。曾任美国妙佑医疗国际生信高级科学家，助理教授，美国内布拉斯加大学林肯分校客座教授。四川省“天府峨眉计划”青年人才，成都市”蓉漂计划青年科学家“。 主要从事基因组学，作物适应性进化以及作物抗逆遗传机理方面的研究。利用数量遗传学，多组学整合与学科交叉等方法挖掘玉米及其近缘种的抗逆机制。近年来，以第一作者（含共一)或通讯作者在Nature Communications, Nature Structural Molecular Biology, Genome Biology, PLoS Genetics, 等国际期刊发表论文 10 余篇。
吴 志聪, Field Applications Scientist, Oxford Nanopore Technologies毕业于暨南大学遗传学专业，曾就职于eppendorf，illumina等企业。具有超过10年的分子生物学及基因组学的技术支持经验。对于二代测序及三代测序技术原理、文库构建、仪器操作以及生物信息学分析等均具有丰富的经验。
Oxford Nanopore测序技术其长度长和表观遗传信息直接检测的优势，在癌症研究中有着很多的着力点。全基因测序在SV和CNV突变的检测、甲基化分析填补了二代短读长测序的短板。此外，包括全长转录组、单细胞转录组和空间转录组等RNA水平上的应用，在帮助癌症诊断和解析发病机制方面有着显著的优势。
Oxford Nanopore测序技术其长度长和表观遗传信息直接检测的优势，在癌症研究中有着很多的着力点。全基因测序在SV和CNV突变的检测、甲基化分析填补了二代短读长测序的短板。此外，包括全长转录组、单细胞转录组和空间转录组等RNA水平上的应用，在帮助癌症诊断和解析发病机制方面有着显著的优势。
王 诗博, Senior Clinical Sales Specialist, Oxford Nanopore Technologies
